Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SfswapQ3USH5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SfswapQ3USH5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SfswapQ3USH5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SfswapQ3USH5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SfswapQ3USH5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms