Protein–RNA interactions for Protein: Q3US60

BC025920, MCG148085, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC025920Q3US60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC025920Q3US60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC025920Q3US60 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC025920Q3US60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms