Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm28047Q3US59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm28047Q3US59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gm28047Q3US59 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gm28047Q3US59 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm28047Q3US59 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms