Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Acsf3Q3URE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Acsf3Q3URE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Acsf3Q3URE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsf3Q3URE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms