Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E130208F15RikQ3UPV3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms