Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mccc2Q3ULD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mccc2Q3ULD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mccc2Q3ULD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mccc2Q3ULD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms