Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smu1Q3UKJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smu1Q3UKJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smu1Q3UKJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smu1Q3UKJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smu1Q3UKJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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