Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccser2Q3UHI0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser2Q3UHI0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser2Q3UHI0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser2Q3UHI0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms