Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trip13Q3UA06 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trip13Q3UA06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trip13Q3UA06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trip13Q3UA06 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Trip13Q3UA06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms