Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VwceQ3U515 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VwceQ3U515 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VwceQ3U515 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VwceQ3U515 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms