Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tatdn3Q3U1C6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tatdn3Q3U1C6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tatdn3Q3U1C6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tatdn3Q3U1C6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tatdn3Q3U1C6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms