Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TraddQ3U0V2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TraddQ3U0V2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TraddQ3U0V2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TraddQ3U0V2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms