Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KhsrpQ3U0V1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KhsrpQ3U0V1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KhsrpQ3U0V1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KhsrpQ3U0V1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KhsrpQ3U0V1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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