Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tbc1d2bQ3U0J8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d2bQ3U0J8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms