Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ODF3L2Q3SX64 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3L2Q3SX64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ODF3L2Q3SX64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms