Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
KRTAP21-1Q3LI58 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms