Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL38Q2WGJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL38Q2WGJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL38Q2WGJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms