Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KLHL40Q2TBA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL40Q2TBA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL40Q2TBA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms