Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT24Q2M2I5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT24Q2M2I5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT24Q2M2I5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT24Q2M2I5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT24Q2M2I5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms