Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RTL8BQ17RB0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RTL8BQ17RB0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTL8BQ17RB0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTL8BQ17RB0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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