Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ME3Q16798 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ME3Q16798 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ME3Q16798 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ME3Q16798 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ME3Q16798 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ME3Q16798 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ME3Q16798 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ME3Q16798 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ME3Q16798 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ME3Q16798 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ME3Q16798 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ME3Q16798 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ME3Q16798 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ME3Q16798 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ME3Q16798 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ME3Q16798 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ME3Q16798 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ME3Q16798 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ME3Q16798 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ME3Q16798 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ME3Q16798 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ME3Q16798 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ME3Q16798 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ME3Q16798 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ME3Q16798 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ME3Q16798 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ME3Q16798 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ME3Q16798 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ME3Q16798 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ME3Q16798 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ME3Q16798 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ME3Q16798 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ME3Q16798 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ME3Q16798 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ME3Q16798 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ME3Q16798 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ME3Q16798 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ME3Q16798 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ME3Q16798 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ME3Q16798 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ME3Q16798 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ME3Q16798 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ME3Q16798 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ME3Q16798 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ME3Q16798 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ME3Q16798 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ME3Q16798 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ME3Q16798 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ME3Q16798 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ME3Q16798 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ME3Q16798 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ME3Q16798 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ME3Q16798 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ME3Q16798 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ME3Q16798 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ME3Q16798 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ME3Q16798 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ME3Q16798 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ME3Q16798 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ME3Q16798 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ME3Q16798 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ME3Q16798 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ME3Q16798 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ME3Q16798 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ME3Q16798 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ME3Q16798 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ME3Q16798 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ME3Q16798 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ME3Q16798 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ME3Q16798 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ME3Q16798 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ME3Q16798 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ME3Q16798 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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