Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA3Q16787 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA3Q16787 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA3Q16787 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA3Q16787 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LAMA3Q16787 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA3Q16787 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMA3Q16787 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LAMA3Q16787 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA3Q16787 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA3Q16787 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA3Q16787 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA3Q16787 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA3Q16787 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA3Q16787 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA3Q16787 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMA3Q16787 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA3Q16787 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA3Q16787 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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