Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKN3Q16667 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKN3Q16667 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKN3Q16667 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDKN3Q16667 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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