Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIK5Q16478 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIK5Q16478 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIK5Q16478 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIK5Q16478 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
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