Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF56Q15929 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF56Q15929 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF56Q15929 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms