Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD8Q15843 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD8Q15843 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD8Q15843 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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