Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF1CQ15572 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TAF1CQ15572 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF1CQ15572 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TAF1CQ15572 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF1CQ15572 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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