Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCP1Q15431 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP1Q15431 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP1Q15431 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYCP1Q15431 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYCP1Q15431 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYCP1Q15431 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYCP1Q15431 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYCP1Q15431 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYCP1Q15431 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYCP1Q15431 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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