Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RYR3Q15413 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RYR3Q15413 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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