Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABEP1Q15276 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RABEP1Q15276 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABEP1Q15276 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RABEP1Q15276 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABEP1Q15276 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
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