Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFRLQ15198 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDGFRLQ15198 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFRLQ15198 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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