Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK3Q15120 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK3Q15120 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDK3Q15120 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDK3Q15120 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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