Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETDB1Q15047 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SETDB1Q15047 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SETDB1Q15047 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SETDB1Q15047 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms