Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NCAPD2Q15021 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NCAPD2Q15021 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NCAPD2Q15021 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCAPD2Q15021 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NCAPD2Q15021 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCAPD2Q15021 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms