Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.131e-10■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.151e-10■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 IARS-204ENST00000430417 414 ntTSL 37.76□□□□□ -1.171e-323■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.741e-323■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-15■■■■■ 29.5
NOLC1Q14978 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 36.96□□□□□ -1.31e-323■■■■■ 29.4
NOLC1Q14978 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-323■■■■■ 29.3
NOLC1Q14978 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.34□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 29.3
NOLC1Q14978 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 35.05□□□□□ -1.61e-323■■■■■ 29.3
NOLC1Q14978 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 220.28■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 29.2
NOLC1Q14978 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 29.2
NOLC1Q14978 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 29.2
NOLC1Q14978 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 29.2
NOLC1Q14978 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 29.2
NOLC1Q14978 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-9■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 37.16□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.426e-9■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.536e-9■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 24.36□□□□□ -1.711e-323■■■■■ 29.1
NOLC1Q14978 HIST1H3D-203ENST00000635641 1637 ntTSL 519.58■□□□□ 0.721e-10■■■■■ 29
NOLC1Q14978 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-10■■■■■ 29
NOLC1Q14978 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-10■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.925e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.155e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-203ENST00000525981 297 ntTSL 515.99■□□□□ 0.155e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-212ENST00000534599 651 ntTSL 514.38□□□□□ -0.115e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.125e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-208ENST00000530913 805 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.415e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.545e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.155e-25■■■■■ 29
NOLC1Q14978 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 28.9
NOLC1Q14978 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.226e-9■■■■■ 28.9
NOLC1Q14978 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.286e-9■■■■■ 28.9
NOLC1Q14978 SLC39A7-204ENST00000463972 1410 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-10■■■■■ 28.8
NOLC1Q14978 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.181e-323■■■■■ 28.8
NOLC1Q14978 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-205ENST00000534029 422 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 NDUFC2-202ENST00000525085 495 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.944e-20■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 225.67■■□□□ 1.72e-14■■■■■ 28.7
NOLC1Q14978 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.071e-7■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 516.51■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.916e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.496e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 PSMD1-212ENST00000491229 546 ntTSL 24.86□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 28.6
NOLC1Q14978 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.295e-9■■■■■ 28.5
NOLC1Q14978 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 28.5
NOLC1Q14978 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 28.5
NOLC1Q14978 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt21.93■■□□□ 1.16e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt21.27■■□□□ 16e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.956e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.626e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.9■□□□□ 0.466e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.436e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.576e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-205ENST00000422745 1865 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.676e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-213ENST00000454046 1947 ntTSL 59.64□□□□□ -0.876e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.16e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.176e-10■■■■■ 28.4
NOLC1Q14978 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.479e-17■■■■■ 28.3
NOLC1Q14978 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.739e-17■■■■■ 28.3
NOLC1Q14978 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.749e-17■■■■■ 28.3
NOLC1Q14978 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.75□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 28.3
NOLC1Q14978 HLA-C-206ENST00000470363 1279 nt12.52□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.1
NOLC1Q14978 SF3B3-206ENST00000565990 967 ntTSL 213.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 28
NOLC1Q14978 SLC25A5-203ENST00000463551 433 ntTSL 26.54□□□□□ -1.361e-17■■■■■ 28
NOLC1Q14978 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 421.25■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 27.9
NOLC1Q14978 UGDH-204ENST00000505698 433 ntTSL 45.66□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 27.9
NOLC1Q14978 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 SEC13-219ENST00000492602 393 ntTSL 35.76□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 220.65■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 310.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 210.02□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 27.8
NOLC1Q14978 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 27.6
NOLC1Q14978 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 27.6
NOLC1Q14978 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 27.6
NOLC1Q14978 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 27.6
NOLC1Q14978 RPL3-206ENST00000453303 916 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 27.5
NOLC1Q14978 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-13■■■■■ 27.5
NOLC1Q14978 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-13■■■■■ 27.5
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