Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPNMBQ14956 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPNMBQ14956 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPNMBQ14956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
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