Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CIRBPQ14011 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CIRBPQ14011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIRBPQ14011 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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