Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CDK13Q14004 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK13Q14004 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK13Q14004 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CDK13Q14004 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CDK13Q14004 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
CDK13Q14004 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CDK13Q14004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
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