Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DCLRE1C-205ENST00000378249 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.646e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.76e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.776e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-207ENST00000378255 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.816e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-205ENST00000558548 745 ntTSL 39.81□□□□□ -0.846e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 MRPS11-211ENST00000561262 726 ntTSL 29.36□□□□□ -0.916e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.976e-12■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.457e-25■■■■■ 51.2
PABPC4Q13310 UNC45A-204ENST00000471780 1730 ntTSL 521.28■■□□□ 13e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-207ENST00000487875 2641 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-11■■■■■ 51
PABPC4Q13310 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 51
PABPC4Q13310 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-22■■■■■ 50.9
PABPC4Q13310 TRIM33-206ENST00000492227 355 ntTSL 26.95□□□□□ -1.32e-22■■■■■ 50.9
PABPC4Q13310 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PGLS-203ENST00000595782 651 ntTSL 321.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.883e-15■■■■■ 50.7
PABPC4Q13310 NECAB3-207ENST00000478237 827 ntTSL 227.14■■□□□ 1.949e-8■■■■■ 50.6
PABPC4Q13310 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 527.14■■□□□ 1.949e-8■■■■■ 50.6
PABPC4Q13310 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 523.57■■□□□ 1.369e-8■■■■■ 50.6
PABPC4Q13310 C21orf59-205ENST00000431599 417 ntTSL 313.76□□□□□ -0.219e-25■■■■■ 50.6
PABPC4Q13310 RNF149-202ENST00000424632 2010 ntTSL 222.47■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 RNF149-205ENST00000485752 621 ntTSL 57.17□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GALNT1-203ENST00000589189 2346 ntTSL 58.19□□□□□ -1.12e-22■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.762e-22■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.072e-11■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 DNAJB6-211ENST00000459889 7992 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ 02e-11■■■■■ 50.3
PABPC4Q13310 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.265e-8■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 PUSL1-205ENST00000493657 1783 ntTSL 225.21■■□□□ 1.639e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.469e-7■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.745e-9■■■■■ 50.1
PABPC4Q13310 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.85e-25■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-25■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.611e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-19■■■■■ 49.7
PABPC4Q13310 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-9■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 49.5
PABPC4Q13310 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 49.4
PABPC4Q13310 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.852e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TP53I13-202ENST00000378818 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.4■■□□□ 1.662e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.632e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TP53I13-206ENST00000579674 2468 nt22■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-206ENST00000536532 1356 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.716e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 ADA-202ENST00000464097 1770 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.26e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-204ENST00000601520 495 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.026e-22■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 PABPC4-224ENST00000530186 352 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 IRGQ-202ENST00000596409 3752 nt6.18□□□□□ -1.422e-11■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.592e-13■■■■■ 49.3
PABPC4Q13310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.291e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.041e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.651e-7■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 EMP2-202ENST00000359543 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 49.2
PABPC4Q13310 GEMIN6-202ENST00000409011 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ENTPD3-AS1-202ENST00000425156 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.577e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ENTPD3-AS1-203ENST00000439293 539 ntTSL 44.36□□□□□ -1.717e-7■■■■■ 49
PABPC4Q13310 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ARID1B-211ENST00000635928 1551 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 OOEP-202ENST00000370363 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 OOEP-203ENST00000441145 964 ntTSL 312.79□□□□□ -0.362e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.842e-27■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 48.8
PABPC4Q13310 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.326e-32■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-209ENST00000514253 904 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATG10-205ENST00000508814 413 ntTSL 34.23□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 57.15□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-323■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 ATOX1-204ENST00000522145 423 ntTSL 210.93□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 48.7
PABPC4Q13310 UBE2M-204ENST00000596985 349 ntTSL 39.38□□□□□ -0.915e-65■■■■■ 48.6
PABPC4Q13310 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-27■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-27■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 225.22■■□□□ 1.632e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 213.62□□□□□ -0.232e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-88■■■■■ 48.5
PABPC4Q13310 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 48.4
PABPC4Q13310 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.316e-17■■■■■ 48.3
PABPC4Q13310 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.086e-17■■■■■ 48.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 585 ms