Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3FQ13275 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SEMA3FQ13275 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA3FQ13275 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA3FQ13275 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA3FQ13275 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
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