Protein–RNA interactions for Protein: Q12979

ABR, Active breakpoint cluster region-related protein, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRQ12979 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABRQ12979 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRQ12979 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABRQ12979 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABRQ12979 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABRQ12979 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRQ12979 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ABRQ12979 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABRQ12979 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRQ12979 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABRQ12979 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRQ12979 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABRQ12979 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRQ12979 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRQ12979 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRQ12979 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRQ12979 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABRQ12979 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABRQ12979 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ABRQ12979 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABRQ12979 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABRQ12979 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABRQ12979 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABRQ12979 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRQ12979 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRQ12979 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRQ12979 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRQ12979 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABRQ12979 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABRQ12979 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRQ12979 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRQ12979 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRQ12979 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABRQ12979 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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