Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
GRIN2AQ12879 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GRIN2AQ12879 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
GRIN2AQ12879 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.32■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
GRIN2AQ12879 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GRIN2AQ12879 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GRIN2AQ12879 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
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