Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF3C1Q12789 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C1Q12789 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF3C1Q12789 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF3C1Q12789 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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