Protein–RNA interactions for Protein: Q12330

SME1, Small nuclear ribonucleoprotein E, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SME1Q12330 EMP65YER140W 1671 nt5.89□□□□□ -1.47
SME1Q12330 ASN2YGR124W 1719 nt5.89□□□□□ -1.47
SME1Q12330 ERS1YCR075C 783 nt5.89□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YAL045CYAL045C 309 nt5.89□□□□□ -1.47
SME1Q12330 HBN1YCL026C-B 582 nt5.89□□□□□ -1.47
SME1Q12330 PGI1YBR196C 1665 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YLL066CYLL066C 3618 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YIP4YGL198W 708 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 DSC3YOR223W 879 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 OPI11YPR044C 354 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 CLN1YMR199W 1641 nt5.88□□□□□ -1.47
SME1Q12330 SKI2YLR398C 3864 nt5.87□□□□□ -1.47
SME1Q12330 SPS1YDR523C 1473 nt5.87□□□□□ -1.47
SME1Q12330 PSA1YDL055C 1086 nt5.86□□□□□ -1.47
SME1Q12330 SUR7YML052W 909 nt5.86□□□□□ -1.47
SME1Q12330 MIX17YMR002W 471 nt5.86□□□□□ -1.47
SME1Q12330 BDF2YDL070W 1917 nt5.86□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YBR241CYBR241C 1467 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 CEM1YER061C 1329 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 GFA1YKL104C 2154 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 HGH1YGR187C 1185 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YJL160CYJL160C 864 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YPL041CYPL041C 624 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 SLA2YNL243W 2907 nt5.85□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YIL168WYIL168W 384 nt5.84□□□□□ -1.47
SME1Q12330 ERG27YLR100W 1044 nt5.84□□□□□ -1.47
SME1Q12330 YNR014WYNR014W 639 nt5.84□□□□□ -1.47
SME1Q12330 RPL43AYPR043W 279 nt5.84□□□□□ -1.47
SME1Q12330 FCY1YPR062W 477 nt5.84□□□□□ -1.47
SME1Q12330 MSG5YNL053W 1470 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 RGT2YDL138W 2292 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 IRC5YFR038W 2562 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 HOG1YLR113W 1308 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 MRPL28YDR462W 444 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 CTF8YHR191C 402 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 OPI8YKR035C 642 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 ECM38YLR299W 1983 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 EHD3YDR036C 1503 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 DLD1YDL174C 1764 nt5.83□□□□□ -1.48
SME1Q12330 GPA1YHR005C 1419 nt5.82□□□□□ -1.48
SME1Q12330 MFT1YML062C 1179 nt5.82□□□□□ -1.48
SME1Q12330 CIT3YPR001W 1461 nt5.82□□□□□ -1.48
SME1Q12330 YCR061WYCR061W 1896 nt5.81□□□□□ -1.48
SME1Q12330 SPR1YOR190W 1338 nt5.81□□□□□ -1.48
SME1Q12330 PAU15YIR041W 375 nt5.81□□□□□ -1.48
SME1Q12330 COX16YJL003W 357 nt5.81□□□□□ -1.48
SME1Q12330 YJL213WYJL213W 996 nt5.81□□□□□ -1.48
SME1Q12330 ATG22YCL038C 1587 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 PPH22YDL188C 1134 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 SHO1YER118C 1104 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 HSP12YFL014W 330 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 THR1YHR025W 1074 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 CCW12YLR110C 402 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.8□□□□□ -1.48
SME1Q12330 ECM30YLR436C 3825 nt5.79□□□□□ -1.48
SME1Q12330 FPR2YDR519W 408 nt5.79□□□□□ -1.48
SME1Q12330 ERV2YPR037C 591 nt5.79□□□□□ -1.48
SME1Q12330 PSP2YML017W 1782 nt5.79□□□□□ -1.48
SME1Q12330 GLN3YER040W 2193 nt5.79□□□□□ -1.48
SME1Q12330 SKP1YDR328C 585 nt5.78□□□□□ -1.48
SME1Q12330 PET117YER058W 324 nt5.78□□□□□ -1.48
SME1Q12330 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.78□□□□□ -1.48
SME1Q12330 STS1YIR011C 960 nt5.78□□□□□ -1.48
SME1Q12330 CPT1YNL130C 1182 nt5.78□□□□□ -1.48
SME1Q12330 SWM1YDR260C 513 nt5.77□□□□□ -1.49
SME1Q12330 SDH8YBR269C 417 nt5.77□□□□□ -1.49
SME1Q12330 NMD5YJR132W 3147 nt5.77□□□□□ -1.49
SME1Q12330 PNS1YOR161C 1620 nt5.77□□□□□ -1.49
SME1Q12330 TDH1YJL052W 999 nt5.76□□□□□ -1.49
SME1Q12330 YOL099CYOL099C 492 nt5.76□□□□□ -1.49
SME1Q12330 PAC2YER007W 1557 nt5.76□□□□□ -1.49
SME1Q12330 CTA1YDR256C 1548 nt5.75□□□□□ -1.49
SME1Q12330 GRH1YDR517W 1119 nt5.75□□□□□ -1.49
SME1Q12330 IDP3YNL009W 1263 nt5.75□□□□□ -1.49
SME1Q12330 RPL5YPL131W 894 nt5.75□□□□□ -1.49
SME1Q12330 YBR226CYBR226C 411 nt5.75□□□□□ -1.49
SME1Q12330 TUF1YOR187W 1314 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 OSM1YJR051W 1506 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 GTT3YEL017W 1014 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 UTR5YEL035C 501 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 PIL1YGR086C 1020 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 RRP46YGR095C 672 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 HMS2YJR147W 1077 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 HRB1YNL004W 1365 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 ADE17YMR120C 1779 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 RGD2YFL047W 2145 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 PHO3YBR092C 1404 nt5.74□□□□□ -1.49
SME1Q12330 CIT2YCR005C 1383 nt5.73□□□□□ -1.49
SME1Q12330 HPT1YDR399W 666 nt5.73□□□□□ -1.49
SME1Q12330 RAD51YER095W 1203 nt5.73□□□□□ -1.49
SME1Q12330 ATP4YPL078C 735 nt5.73□□□□□ -1.49
SME1Q12330 DMC1YER179W 1005 nt5.72□□□□□ -1.49
SME1Q12330 POX1YGL205W 2247 nt5.72□□□□□ -1.49
SME1Q12330 YPL247CYPL247C 1572 nt5.72□□□□□ -1.49
SME1Q12330 YNL017CYNL017C 339 nt5.71□□□□□ -1.5
SME1Q12330 DPM1YPR183W 804 nt5.71□□□□□ -1.5
SME1Q12330 TRS31YDR472W 852 nt5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.6 ms