Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YLL056CYLL056C 897 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-GR3Q12316 RAD59YDL059C 717 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-GR3Q12316 CKB1YGL019W 837 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-GR3Q12316 YHL008CYHL008C 1884 nt10.72□□□□□ -0.69
TY1B-GR3Q12316 YOL099CYOL099C 492 nt10.7□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 VMA3YEL027W 483 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 ORT1YOR130C 879 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 ERR1YOR393W 1314 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 ERR2YPL281C 1314 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 MOG1YJR074W 657 nt10.68□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 NAS6YGR232W 687 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 CSL4YNL232W 879 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 ERG24YNL280C 1317 nt10.66□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 SNA3YJL151C 402 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 TPO4YOR273C 1980 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 PFS2YNL317W 1398 nt10.65□□□□□ -0.7
TY1B-GR3Q12316 CYT1YOR065W 930 nt10.65□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 LIP5YOR196C 1245 nt10.65□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 ICP55YER078C 1536 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 PDC5YLR134W 1692 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 PGI1YBR196C 1665 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 YGL102CYGL102C 429 nt10.64□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 YGL114WYGL114W 2178 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 AFG3YER017C 2286 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 TIF2YJL138C 1188 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 TIF1YKR059W 1188 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 CUE4YML101C 354 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 IVY1YDR229W 1362 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 HMG2YLR450W 3138 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 SMX3YPR182W 261 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 HED1YDR014W-A 489 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 OM45YIL136W 1182 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 SEN34YAR008W 828 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 MRPL10YNL284C 969 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 HNM1YGL077C 1692 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 HSL7YBR133C 2484 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 YBR027CYBR027C 333 nt10.6□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 MSP1YGR028W 1089 nt10.6□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 HPT1YDR399W 666 nt10.59□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 REC107YJR021C 945 nt10.59□□□□□ -0.71
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 ERG27YLR100W 1044 nt10.58□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YMR279CYMR279C 1623 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 PEX3YDR329C 1326 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 DON1YDR273W 1098 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 CUP2YGL166W 678 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 EGD2YHR193C 525 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 snR4snR4 186 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 DSF1YEL070W 1509 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YNR073CYNR073C 1509 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 ERG8YMR220W 1356 nt10.56□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 MHT1YLL062C 975 nt10.55□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 PRI1YIR008C 1230 nt10.54□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 NBA1YOL070C 1506 nt10.54□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt10.54□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 RPL43AYPR043W 279 nt10.54□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YKL077WYKL077W 1179 nt10.53□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 DUS3YLR401C 2007 nt10.53□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 GTS1YGL181W 1191 nt10.52□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 SUR7YML052W 909 nt10.52□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 MRPL23YOR150W 492 nt10.52□□□□□ -0.72
TY1B-GR3Q12316 YPR196WYPR196W 1413 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 MIM1YOL026C 342 nt10.52□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 TPI1YDR050C 747 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 PMT1YDL095W 2454 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 DLD1YDL174C 1764 nt10.51□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt10.5□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 YAR064WYAR064W 300 nt10.5□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 SEC62YPL094C 825 nt10.5□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 YAL045CYAL045C 309 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 CDC7YDL017W 1524 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 SYF2YGR129W 648 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 UIP5YKR044W 1332 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 PTC7YHR076W 1032 nt10.48□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 ECM19YLR390W 339 nt10.48□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 HVG1YER039C 750 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 HIS1YER055C 894 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 SPG5YMR191W 1122 nt10.47□□□□□ -0.73
TY1B-GR3Q12316 MPC2YHR162W 390 nt10.46□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 RNH1YMR234W 1047 nt10.46□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 YNL017CYNL017C 339 nt10.45□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 FRA1YLL029W 2250 nt10.45□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 ELA1YNL230C 1140 nt10.44□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 THR1YHR025W 1074 nt10.43□□□□□ -0.74
TY1B-GR3Q12316 CTA1YDR256C 1548 nt10.43□□□□□ -0.74
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