Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 DCR2YLR361C 1737 nt8.1□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 TPI1YDR050C 747 nt8.1□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.1□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 PDA1YER178W 1263 nt8.1□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 YPR130CYPR130C 408 nt8.1□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 PDC5YLR134W 1692 nt8.09□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 SML1YML058W 315 nt8.09□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 PUS4YNL292W 1212 nt8.09□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 NMD5YJR132W 3147 nt8.09□□□□□ -1.11
CLF1Q12309 NAF1YNL124W 1479 nt8.08□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 CHA1YCL064C 1083 nt8.08□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.08□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 DPM1YPR183W 804 nt8.08□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 PRC1YMR297W 1599 nt8.08□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 YOR111WYOR111W 699 nt8.07□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 RUP1YOR138C 2016 nt8.07□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 ASN2YGR124W 1719 nt8.06□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 CIA1YDR267C 993 nt8.06□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 SNA3YJL151C 402 nt8.06□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 RTC4YNL254C 1206 nt8.06□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 ITR1YDR497C 1755 nt8.06□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 ERR3YMR323W 1314 nt8.05□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.05□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 SGF73YGL066W 1974 nt8.04□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 AFG3YER017C 2286 nt8.04□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 HXT13YEL069C 1695 nt8.04□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 TOP3YLR234W 1971 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 HNM1YGL077C 1692 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 ERG10YPL028W 1197 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 YPL264CYPL264C 1062 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 CYS4YGR155W 1524 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 BIO3YNR058W 1443 nt8.03□□□□□ -1.12
CLF1Q12309 LDB7YBL006C 543 nt8.02□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 PLB2YMR006C 2121 nt8.02□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.02□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.02□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.02□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YOS9YDR057W 1629 nt8.01□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 RPL43AYPR043W 279 nt8.01□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YPR076WYPR076W 375 nt8.01□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YCL049CYCL049C 939 nt8.01□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 HDA1YNL021W 2121 nt8□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 HTZ1YOL012C 405 nt8□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 MPH3YJR160C 1809 nt8□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 HXT9YJL219W 1704 nt7.99□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YBL113CYBL113C 2379 nt7.99□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 ADE17YMR120C 1779 nt7.99□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 PRP2YNR011C 2631 nt7.99□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 SPE4YLR146C 903 nt7.98□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YMR074CYMR074C 438 nt7.98□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YJL163CYJL163C 1668 nt7.98□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 GNA1YFL017C 480 nt7.97□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YNR005CYNR005C 405 nt7.97□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YOL046CYOL046C 675 nt7.97□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 TOS2YGR221C 1869 nt7.97□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 YKR023WYKR023W 1593 nt7.97□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 CDC13YDL220C 2775 nt7.96□□□□□ -1.13
CLF1Q12309 TCB1YOR086C 3561 nt7.96□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 DPH5YLR172C 903 nt7.96□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.96□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 CDC7YDL017W 1524 nt7.96□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 GPD1YDL022W 1176 nt7.95□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 HOC1YJR075W 1191 nt7.95□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 SRY1YKL218C 981 nt7.95□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 RDR1YOR380W 1641 nt7.95□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 BRN1YBL097W 2265 nt7.95□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 FCY22YER060W-A 1593 nt7.94□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 LIA1YJR070C 978 nt7.94□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YKL147CYKL147C 618 nt7.94□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YNL040WYNL040W 1371 nt7.94□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 LIP5YOR196C 1245 nt7.93□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 FIT2YOR382W 462 nt7.93□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 HSM3YBR272C 1443 nt7.93□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 HAL5YJL165C 2568 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 PPH21YDL134C 1110 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 MRPL35YDR322W 1104 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 DMC1YER179W 1005 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 AGX1YFL030W 1158 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 GTS1YGL181W 1191 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YGL260WYGL260W 231 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YOL099CYOL099C 492 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YOR041CYOR041C 432 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 MSS51YLR203C 1311 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 COX15YER141W 1461 nt7.92□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 APE4YHR113W 1473 nt7.91□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YLR030WYLR030W 792 nt7.9□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 ERG27YLR100W 1044 nt7.9□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 ATP10YLR393W 840 nt7.9□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 YMR253CYMR253C 1245 nt7.9□□□□□ -1.14
CLF1Q12309 MAL31YBR298C 1845 nt7.89□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 ATO2YNR002C 849 nt7.89□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 PGI1YBR196C 1665 nt7.89□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 ATG22YCL038C 1587 nt7.88□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 YIP4YGL198W 708 nt7.87□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 ERR1YOR393W 1314 nt7.86□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 ERR2YPL281C 1314 nt7.86□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 BIM1YER016W 1035 nt7.86□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 NTG2YOL043C 1143 nt7.86□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 SSC1YJR045C 1965 nt7.86□□□□□ -1.15
CLF1Q12309 YCR049CYCR049C 447 nt7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.1 ms