Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 YLR162WYLR162W 357 nt8.24□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 BRN1YBL097W 2265 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 YER137CYER137C 447 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 LOT6YLR011W 576 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 YMR253CYMR253C 1245 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 SUN4YNL066W 1263 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 PUS7YOR243C 2031 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 ERR3YMR323W 1314 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 ERR1YOR393W 1314 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 ERR2YPL281C 1314 nt8.23□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 THR1YHR025W 1074 nt8.22□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 ATP10YLR393W 840 nt8.22□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 LAS17YOR181W 1902 nt8.21□□□□□ -1.09
RIM20Q12033 HPT1YDR399W 666 nt8.21□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 DTR1YBR180W 1719 nt8.2□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 MCP1YOR228C 909 nt8.2□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.19□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 SML1YML058W 315 nt8.18□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 HTZ1YOL012C 405 nt8.18□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 YAL045CYAL045C 309 nt8.17□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 URA1YKL216W 945 nt8.17□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 YNR005CYNR005C 405 nt8.17□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 YPR127WYPR127W 1038 nt8.17□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 IRC5YFR038W 2562 nt8.17□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 NUP84YDL116W 2181 nt8.16□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 SNF4YGL115W 969 nt8.15□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 NTG2YOL043C 1143 nt8.15□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 LGE1YPL055C 999 nt8.15□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 MET8YBR213W 825 nt8.15□□□□□ -1.1
RIM20Q12033 MHP1YJL042W 4197 nt8.15□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 POB3YML069W 1659 nt8.14□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 APE4YHR113W 1473 nt8.14□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YOL099CYOL099C 492 nt8.14□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 SPE3YPR069C 882 nt8.14□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 ILV2YMR108W 2064 nt8.13□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 MSG5YNL053W 1470 nt8.13□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 BNA3YJL060W 1335 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 TDP1YBR223C 1635 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 RFC1YOR217W 2586 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YCR041WYCR041W 333 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YIP4YGL198W 708 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 GTB1YDR221W 2109 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 DLD1YDL174C 1764 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YLL058WYLL058W 1728 nt8.12□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 MIX17YMR002W 471 nt8.11□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YOL046CYOL046C 675 nt8.11□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YJL163CYJL163C 1668 nt8.11□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YOR012WYOR012W 414 nt8.1□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 BIO3YNR058W 1443 nt8.1□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 AQR1YNL065W 1761 nt8.1□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YJL144WYJL144W 315 nt8.09□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 REC107YJR021C 945 nt8.09□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 YLR112WYLR112W 420 nt8.09□□□□□ -1.11
RIM20Q12033 MPH3YJR160C 1809 nt8.08□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 CEM1YER061C 1329 nt8.08□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 LDB7YBL006C 543 nt8.08□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 PUS4YNL292W 1212 nt8.08□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 ERG10YPL028W 1197 nt8.08□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 FIT2YOR382W 462 nt8.06□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 SNT309YPR101W 528 nt8.06□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 RFS1YBR052C 633 nt8.05□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 GNP1YDR508C 1992 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 FCP1YMR277W 2199 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 AGX1YFL030W 1158 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 AIM2YAL049C 741 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 RPL31BYLR406C 342 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 SPG5YMR191W 1122 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 AAD14YNL331C 1131 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 YPR076WYPR076W 375 nt8.04□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 PLB3YOL011W 2061 nt8.03□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 YGL102CYGL102C 429 nt8.03□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 ICP55YER078C 1536 nt8.03□□□□□ -1.12
RIM20Q12033 MSC3YLR219W 2187 nt8.02□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 AMN1YBR158W 1650 nt8.02□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 VBA5YKR105C 1749 nt8.01□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 MRPL28YDR462W 444 nt8.01□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 NUP49YGL172W 1419 nt8.01□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 TUF1YOR187W 1314 nt8.01□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 MRPS28YDR337W 861 nt8□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 PTC7YHR076W 1032 nt8□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 CBR1YIL043C 855 nt8□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 PRI1YIR008C 1230 nt8□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 PPH21YDL134C 1110 nt7.99□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 URH1YDR400W 1023 nt7.99□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 MTR3YGR158C 753 nt7.99□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 SMX3YPR182W 261 nt7.99□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 TRS31YDR472W 852 nt7.98□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 YLL056CYLL056C 897 nt7.98□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 SEC62YPL094C 825 nt7.98□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 ERS1YCR075C 783 nt7.97□□□□□ -1.13
RIM20Q12033 PAC10YGR078C 600 nt7.96□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 SSC1YJR045C 1965 nt7.96□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 PAC2YER007W 1557 nt7.96□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 COX15YER141W 1461 nt7.95□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 CYS4YGR155W 1524 nt7.95□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 HHY1YEL059W 309 nt7.95□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 ASR1YPR093C 867 nt7.95□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 HOC1YJR075W 1191 nt7.94□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 ARC35YNR035C 1029 nt7.94□□□□□ -1.14
RIM20Q12033 FMP40YPL222W 2067 nt7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.3 ms