Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VgfQ0VGU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VgfQ0VGU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VgfQ0VGU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VgfQ0VGU4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VgfQ0VGU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms