Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp4r2Q0VGB7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp4r2Q0VGB7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ppp4r2Q0VGB7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppp4r2Q0VGB7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms