Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc39dQ0VF76 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc39dQ0VF76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc39dQ0VF76 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ttc39dQ0VF76 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc39dQ0VF76 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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